「ビジュアル設定」または「詳細設定」のいずれかの「設定を保存」ボタンを1度だけクリック(カスタムCSSを再作成)してください。
なお、 対象サイトでは「Autoptimize」というプラグインを利用されているようですが、キャッシュ系のプラグインは、大半が期待されるほどの効果がないだけではなく逆にパフォーマンスの低下や致命的な不具合を引き起こすことが多々あり、今回のような不具合や意図しないレイアウト崩れを突然引き起こす原因になるケースも非常に多くあります。
動的な処理を行うWordPressを利用する上では、無闇にキャッシュ系のプラグインを利用しないようにしてください。